西红柿早疫病和晚疫病在病原菌、发病条件、症状表现及防治方法上存在明显区别，以下是具体对比：

病原菌

早疫病：由半知菌亚门链格孢属真菌引起，属于高等真菌。
晚疫病：由鞭毛菌亚门疫霉属真菌引起，属于低等真菌。
发病时间

早疫病：通常在番茄开花结果期开始发病，结果盛期后因基部叶片老化，病菌积累量大，病情可能加重。
晚疫病：多在苗期和结果期发病，尤其在低温高湿的环境下，如春秋季或阴雨天易爆发。
发病条件

早疫病：适宜发病温度为20℃-28℃，相对湿度高于70%，高温高湿环境易发病。
晚疫病：适宜发病温度为18℃-22℃，相对湿度需达到95%以上，低温高湿是主要发病条件。
症状表现

叶片症状：
早疫病：病斑多从下部叶片开始，呈近圆形或不规则形，有同心轮纹，潮湿时病斑表面长黑色霉层。
晚疫病：病斑从叶尖或叶缘开始，呈水渍状不规则斑，初期为淡绿色，后变为褐色，湿度大时叶背病斑边缘可见白色霉层。
茎秆症状：
早疫病：病斑多在分枝处，呈灰褐色椭圆形，有同心轮纹，严重时病斑围绕茎杆，表面有黑色霉层。
晚疫病：茎秆发病呈水渍状黑褐色病斑，严重时绕茎一周，上下蔓延，湿度大时产生白色霉层，易从病部折断。
果实症状：
早疫病：多从果实与花萼连接部位开始，形成轮纹状病斑，湿度大时病部出现黑色霉层，病果易脱落。
晚疫病：多发生在青果的近果柄处，初期为油渍状或云纹状浅褐色病斑，后期变为深褐色，稍凹陷，湿度大时产生白色霉层，果肉质地坚硬不软腐。
防治方法

早疫病：常用药剂有异菌脲、苯醚甲环唑、氟菌·肟菌酯等，注重轮换用药，避免抗药性产生。
晚疫病：常用药剂有烯酰吗啉、霜霉威、氰霜唑等，需结合保护剂和治疗剂交替使用，及时清除病株并加强田间通风降湿。