一，机械损伤。包括人为误操作造成的水产品伤亡，以及水产品之间相互掐架、残食造成的伤亡。
二，水质调控不当造成的伤亡。水质包括：水温，盐度，溶解氧，ph值。对于水产品而言，这些水质指标既要在合适范围之内，又不能变化幅度过快，否则都会引起发病或死亡。具体来讲，（1）水产品运输，水温应控制在让水产品处于麻醉或镇静状态的温度范围，以便减缓水产品的新陈代谢速度，为运输争取时间。要注意水产品从一个水体转换到另一个水体时，温差不要超过3度，温差超过5度水产品可能在几天后发病，温差超过10度水产品可能在几小时内大量死亡，因为水产品是冷血动物，体温随水温的变化而变化，若水温变化过猛，水产品出现代谢紊乱就会发病或者死亡。夏天死亡率高，水体转换温差大是重要原因。（2）盐度每小时变化幅度应小于3度，绝大多数海水产品适宜盐度在25-28度，淡水产品在2-3度。（3）水中溶解氧含量任何时候不应低于6毫克/升，运输时溶氧量还应该更高，运输中能用纯氧最好。溶解氧含量低于5毫克/升，水产品会因缺氧而死亡。溶解氧肉眼看不出来，需要用溶解氧测试剂测量。（4）ph值就是水的酸碱度。海水产品适宜的ph值在7.5-8.5，最适宜在7.5-8.0。淡水产品适宜的ph值在7.0-8.5，最适宜7.0-8.0。ph值每小时的变化幅度应小于0.3度，一天内变化幅度应小于0.5度。ph值高，加醋降低；ph值低，加小苏打或烧碱提高，每吨水每次加20克。
三，中毒引起的死亡。中毒引起的死亡，占水产品死亡总量的90%以上。即便没有机械损伤，即便水质指标调控得都对，如果中毒了，水产品仍会死亡。中毒主要是由水中的氨和亚硝酸盐含量超标引起的。水生动物和陆生动物、人不同，陆生动物、人体内的蛋白质、氨基酸，是以尿素的形式随尿液排出体外的，但是水生动物体内的蛋白质、氨基酸却是以氨气的方式排出体外的。氨气极易溶于水、很难逸出水面，氨的含量只有低于0.2克/吨水才是安全的，若超过0.6克/吨水，水产品就会烦躁不安，乱窜乱撞，试图逃出水池。若超过2克/吨水，水产品可能在几小时内就大量死亡，死的时候鱼嘴巴张开，鱼身上特别是鳃部满是粘液，鳃丝红肿。据测算，暂养100斤水产品/吨水，6个小时后，氨含量就会超标，水产品就开始中毒。这也就是为什么在不换水的情况下，时间越长水产品死亡率越高的原因。氨和氧气接触，会被氧化成亚硝酸盐，亚硝酸盐也有剧毒。亚硝酸盐的安全含量是0.1克/吨水，超过0.5克/吨水就会让水产品中毒。
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