中国农科院基因组所团队成功获得“YE1-BE3-FNLS”高精度、高活性单碱基编辑工具,研究成果于2020年5月18日在《自然•方法》上在线发表。胞嘧啶碱基编辑器是将切口酶型Cas9蛋白与胞嘧啶脱氨酶融合在一起形成的,靶向DNA或RNA的靶位点中的C-T转化。研究团队根据胞嘧啶脱氨酶蛋白结构预测了基因编辑过程中产生脱靶效应的重要氨基酸,并在不影响催化活性的情况下突变相应的氨基酸。研究筛选出23个合理设计的胞嘧啶碱基编辑器变体,转染HEK293T细胞。结果表明,这些变体揭示了在预测的DNA结合位点的突变残基可以显著降低Cas9非依赖型的脱靶效应。为进一步提高胞嘧啶碱基编辑器变体YE1-BE3的编辑效率,研究学者又在该变体的基础上增加flag标签和核定位序列(FNLS)。最终得到一个胞嘧啶碱基编辑器变体YE1-BE3-FNLS,它在保持较高的目标编辑效率的同时,显著降低了基因编辑的脱靶效应。
来源:《自然•方法》
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