荸荠秆枯病是一种毁灭性病害（有些地方菜农称之为"荸荠瘟"），严重威胁着荸荠的正常生产。荸荠受害后茎秆枯死，严重时茎秆呈现一片枯死、倒伏状，地下部不结球茎；受害轻者所结球茎小，果实畸形，品质下降，产量锐减。
　　1. 为害症状
　　主要为害荸荠的叶鞘、茎秆、花器等部位。
　　①叶鞘。受侵害初期，基部呈现暗绿色不规则形水渍状病斑，以后很快扩展到整个叶鞘，病部在后期干燥后变成灰白色，其上着生有黑色小点或长短不一的黑色线条点，即为该病菌的分生孢子盘。条件适宜时，病菌迅速向上部叶状茎扩散。
　　②茎秆。感病后，初期也呈现水渍状椭圆形、梭形或不定形黑绿色病斑，后期其病斑上也会着生小黑点或黑色短线条点，湿度大时病斑上会产生浅灰色霉层，受害严重时病斑呈条状。此时病茎组织会变得很软，病部凹陷，全株枯死，极易造成茎秆倒伏。
　　③花器。多发生在鳞片或穗颈部，致使花器枯黄，湿度大时病部可产生灰白色霉层。
　　2. 发病特点
　　该病属于真菌性病害，以菌丝体和分生孢子盘随病株遗落在土壤中或球茎上越冬。翌年4月，气候条件适宜时从荸荠的气孔或直接穿透表皮侵入组织内为害，可借助风雨或灌溉水进行传播蔓延。早栽的荸荠在8月初始发病，8～9月是发病盛期；晚栽的荸荠在8月底至9月初始发病，特别是白露节后如遇连续大雾天气，烈日下可成片蔓延发病。该病发生最低温度为5℃，最高温度为32℃，适宜发病温度在23～29℃。
　　荸荠生长期气温在17～29℃时，如遇连阴雨或浓雾、露水重的天气则有利于发病。采用病株球茎留种或在重病田块里连续种植，往往发病早且发病重。此外，荸荠种植过密，封行过早，造成田间通风透光性差；或荸荠生长早期施用氮肥过多，磷钾肥缺乏，植株徒长柔弱等都会加重病情。不同品种间抗病性有一定差异，一般大红袍荸荠比苏荠、桂林马蹄等抗病性强。
　　3. 防控措施
　　①选用抗病品种。老病区可因地制宜栽种番瓜荠、大红袍等较抗病品种，并注意选用无病球茎或轻病田块的球茎留种。
　　②实行3年以上轮作。特别是在荸荠老产区，推行轮作是防治该病最经济有效的措施。种植1茬荸荠后，3年内轮作其他作物，如茭白、莲藕等水生蔬菜或旱生蔬菜，可有效预防该病的发生流行。
　　③加强田间管理。最好做到排灌水分开管理，避免串灌或漫灌；及时拔除田间病株并带出田外烧毁，以防病害传播蔓延；适当增施钾肥，可有效提高荸荠的抗病能力；收获后，及时将田间病残体集中烧毁。
　　④苗前处理。在育苗之前，将种球茎先放在50%克菌丹可湿性粉剂500～700倍液，或50%多菌灵可湿性粉剂500～800倍液，或70%甲基硫菌灵可湿性粉剂800～1000倍液中浸泡18～24小时，然后再进行育苗。定植时，将荸荠苗放在上述药剂中或用50%醚菌酯悬浮剂2000～3000倍液齐腰浸泡，3～5小时后再种植到大田里。
　　⑤药剂防治。在荸荠苗封行前，用50%醚菌酯悬浮剂3000～4000倍液喷雾进行预防，隔15天再喷1次。发病初期，每5天喷1次药，病情控制住以后隔10天喷1次，每次可从以下药剂中选择一种：40%三唑酮·多菌灵可湿性粉剂800～1000倍液，50%多硫可湿性粉剂600～800倍液，50%咪鲜胺可湿性粉剂1000～1200倍液，70%甲基硫菌灵可湿性粉剂800～1000倍液，70%丙森锌可湿性粉剂500～600倍液。值得注意的是，暴雨来临前要喷药防治，雨后要及时补喷药剂，重点保护新生茎秆免遭病菌为害；选择2～3种药剂交替使用，防治效果更佳。