您说的50-60元/斤的水稻种子是南方三系杂交方式生产出来的水稻杂交种子。在东北地区种植的粳稻品种没那么贵，一般都在3-5元/之间.之所以籼稻的杂交种子这么贵，还在于制种的各个过程对于成本的需求。
1、南方三系杂交种子的原理。准确的说，水稻杂交种子的原理是国外的育种家先提出来的，只不过缺少“三系”中最为关键的不育系，一直未能将“三系”杂交育种技术在现实中实现。直到袁隆平先生的弟子李必湖在海南发现的那一株“野败”-雄性不育系，才将“三系”杂交育种技术彻底的在水稻杂交育种领域中应用。


“三系”，既雄性不育系、恢复系、和保持系。其中，恢复系和保持系是在水稻杂交育种的材料中选育出来的品系。通过雄性不育系与保持系杂交，使得雄性不育系能够通过杂交的手段保留下来，仍然保留雄性不育的特性；在雄性不育系与保持系杂交之后，将其后代与恢复系杂交，就是杂交水稻种子。因为恢复系能够将雄性不育的特性恢复成可育，这样的种子种植下去才会结实。而且，“三系”杂交育种技术也是利用遗传学中的“杂种优势”原理，将有优良性状的两个或者以上的父母本进行杂交，让后代表现出超过父母本的性状。比如说在产量、品质、抗性方面，都要比父母本好很多。水稻表现得不明显，玉米的父母本和后代的差异表现最大，如果有机会的话您可以去玉米的杂交育种基地去看看玉米的自交系和杂交种在长势方面的区别。


2、制种过程复杂。在前面我们提到，“三系”杂交育种技术需要雄性不育系与保持系杂交之后，由其后代与恢复系再次进行杂交，才会生产出优质的“三系”杂交种子。这也就意味着，需要经过两个杂交世代的时间，也就是需要种植至少两季，才能生产出优质的“三系”杂交种子。这个过程消耗的时间和其他的类似人力、机械、管理等成本都是比较高的。最简单的一点制种基地的地租，就不是一个小数目；


其次，移栽过程也比较复杂。前面提到，“三系”杂交制种需要两个杂交世代才能完成。而且，南方籼稻制种过程其实与玉米杂交制种技术比较类似。移栽几行不育系，在移栽几行恢复系。之后是移栽几行不育系和保持系的后代，在移栽几行恢复系的后代。期间还要经历去除杂株的过程，是非常繁琐的；


还有就是期间的人工消耗比较大。南方的杂交籼稻制种与东北的粳稻制种有着本质的差异。南方籼稻制种在扬花授粉的过程中，需要人为的用木棍拨弄不育系或者不育系与保持系杂交的后代的穗部，让穗部的花粉飘散开来，才会让保持系和恢复系授粉、结实，才能进行下一步的工作。用行业内的话讲，叫做“赶粉”。所以，杂交籼稻的制种过程非常的繁琐。


3、制种产量低。前面提到的两个杂交过程，只有最后一个过程才是能够生产“三系”杂交籼稻种子的最终阶段。不育系和保持系杂交种植的世代，是打基础，这个杂交世代或者种植季不会生产种子，也就不能产生效益；直至不育系和保持系杂交种植产生的后代与恢复系杂交这个世代，恢复系的结实才是真正的“三系”杂交籼稻种子。而且，需要说明的是，不育系和不育系和保持系杂交种植产生的后代都是不结实的。这也就意味着种植两个杂交世代，能够产生的种子只有正常两个种植时代的1/3左右的产量。期间消耗的成本多么的巨大。


所以，“三系”杂交籼稻种子的售价比较高也是很正常的。制种过程比较复杂、期间消耗的成本较高、制 种产量却很低，售价能便宜吗？好在现在一些水稻育种家也在培育“两系”杂交籼稻，过程相对简单、成本也低一些、价格也低一些。但是在产量方面，“两系”杂交籼稻与“三系”杂交籼稻相比还是有一定的距离。

以上是我对这个问题的一些看法， 如有不当之处请海涵。