生物有机肥与传统化肥相比具有非常多的优点，富含大量有机质，中量元素，微量元素以及多种微生物有益菌群，可以迅速分解有害菌群，长效补充土壤里的有益菌，长期使用能够逐步解除土壤板结和重茬，促进作物快速生长，是种植绿色、高效有机农产品的首选肥料。生物有机肥根据作物的不同选择不同的施肥方法，那么，如何施用生物有机肥？常用的一些施肥方法有：
1.种施法
机播时，将颗粒生物有机肥与少量化肥混匀，随播种机施入土壤。
2.撒施法
结合深耕或在播种时将生物有机肥均匀地施在根系集中分布的区域和经常保持湿润状态的土层中，做到土肥相融。
3.条状沟施法
条播作物或葡萄等果树，开沟后施肥播种或在距离果树5cm处开沟施肥。
4.穴施法
点播或移栽作物，如玉米、棉花、西红柿等，将肥料施入播种穴，然后播种或移栽。
5.蘸根法
对移栽作物，如水稻、西红柿等，按生物有机肥加5份水配成肥料悬浊液，浸蘸苗根，然后定植。
6.盖种肥法
开沟播种后，将生物有机肥均匀地覆盖在种子上面。
生物有机肥用量是不是越多越好？施入生物有机肥能够改良土壤结构，为作物和土壤微生物生长提供良好的营养和环境条件。土壤中施入较多的生物有机肥虽然不会出现像未腐熟的有机肥那样的烧根烧苗现象，但并不是施的越多就越好。这是因为农作物产量的高低与土壤中养分含量低的一种养分有关，土壤中某种营养元素缺乏，即使其它养分再多，农作物的产量也不会在增加。只有向土壤中补偿缺少的小养分后，农作物产量才会增加。另外，当施肥量超过高产量施肥量时，作物的产量便随施肥量的增加而减少，生产投入成本增加而收益却减少，在经济上也不合算。因此，不可盲目大量施用生物有机肥，应根据不同作物的需要和土壤养分状况，科学地确定施肥量，才能达到增产增收的目的。生物有机肥可以用作追肥，追肥是在作物生长发育期间，为及时补充作物生长发育过程中对养分的阶段性需求而采用的施肥方法。追肥能促进作物生长发育，提高作物产量和品质。生物有机肥追施的方法有土壤深施和根外追肥两种。土壤深施一般将生物有机肥施在根系密集层附近，施后覆土，以免造成养分挥发损失。根外追肥是将生物有机肥与10倍的水混合均匀，静止后取其上清液，借助喷雾器将肥料溶液喷洒在作物叶片的正反面。在施肥时注意以下几点:
（1）底肥追肥：每亩用生物有机肥100公斤一200公斤沟施、穴施、撒施均可。
（2）沟施穴施：幼树可环状沟施，每棵树用200克，成年树放射状沟施，每棵用2-10公斤，可拌土施。
（3）拌苗床土：每平方米苗床士用200-300克与苗床土混匀后播种。不同的种植品种，使用量不同，一般每亩地施肥100公斤-200公斤。