油菜菌核病是油菜生产上的重要病害，也是典型的气候型病害，对油菜产量和品质影响较大，因此，做好油菜菌核病的防治要采取“预防为主、综合防治”的策略。防治的关键在始花期和盛花期各喷药一次；同时大力推广应用无人机等高效施药器械进行统防统治，可有效控制菌核病害的蔓延，减轻病害的发生程度。
一、防治的指标
在油菜初花期，当病株率达5—10%时，或盛花期主茎开花株率达80%，一次枝梗开花株率达50%时是施药防治油菜菌核病的最佳时期。
二、采取农业措施
1、及时清沟理墒，降低田间湿度，促进油菜健壮生长，提高抗病能力。
2、及时摘除植株中下部的病、黄、老叶，减少田间菌源量，减轻主茎部受病菌的侵染。
3、抢晴天叶面喷施2—3次叶面肥，一般亩用硼砂或磷酸二氢钾各100克混合喷雾。通过以上措施，可提高油菜抗病力，增加角果数和籽粒重量，减少病害发生，降低农药使用量。
三、选优药剂防治
在油菜初花期、盛花期各防治一次。可亩用50%腐霉利可湿性粉剂75克，或40%菌核净可湿性粉剂50—60克，或70%甲基托布津可湿性粉剂80—100克兑水40—50公斤手动喷雾或兑水15公斤机动迷雾或用植保无人机进行防治。如盛花期遇多雨天气，需在第一次防治后7天再防一次。喷雾时重点对准油菜中下部茎秆，喷头从花到基部茎秆均要喷到，使植株外表形成药剂保护层。