一、加强饲养管理，提高动物的抗病力
首先，要精心饲养。在饲料上要保证能量充足、营养齐全，能满足动物在不同时期的需要，同时还要重视饲料与饮水的卫生，霉烂、变质、刚喷过农药或泥沙、杂质较多的饲草不能饲喂。其次，要加强管理。冬天注意保暖，夏季注意防暑，初生仔畜，还应尽早让其吃到初乳。再次，要有计划地定期驱虫。牛羊的日本血吸虫病、肝片吸虫病、前后盘吸虫病、消化道线虫病、疥螨病，兔的球虫病、疥螨病等都是对草食动物危害严重的寄生虫病，每年要在春秋两季进行预防性驱虫，常用的药物包括：虫克星、阿力佳、吡喹酮、左旋咪唑、杀虫脒、溴菊酯、双甲醚等。
二、改善饲养环境，切断疫病传播途径
一要搞好场地卫生。加强栏舍、饲料、饮水、饲养用具的卫生管理，食槽与用具要经常清洗，栏舍要经常打扫，保持清洁干净，通风透光。二要加强消毒工作。饲养场、放牧场、饲养户要在兽医专家指导下，制定严格的消毒制度，落实消毒措施，规范消毒程序，门卫消毒要多重设置、严格把关，栏舍、食槽、用具等要进行定期消毒。三要维护饲养环境。要做好灭鼠、灭虫工作，饲养区内禁止养犬、进犬，防止犬咬伤家畜和犬粪污染饲草、饮水，同时对垫草、粪尿堆积发酵，病死动物尸体要进行深埋或烧毁，作到无害化。
三、加强调种管理，严防疫病的传入
原则上提倡以“自繁自养”为主，防止从外购进动物而带进疫病。如确需从外地引种，应事先了解该地区过去与现在的疫情以及免疫注射情况，报请引进地动物卫生监督机构批准，并在起运前经当地动物卫生监督机构进行检疫，确无疫情方可引进。跨省引进乳用种用动物的，需经省级动物卫生监督机构进行检疫审批后，方可引进。动物调入后，需经官方兽医验证、检疫，隔离观察45天(鹅、兔等小型动物30天)，确认健康无病后方可混群饲养，隔离期间应做好驱虫、补注疫苗等工作。放牧动物，要严防与外人或外单位的动物接触。
四、定期检疫监测，防止疫病的发生和传播
通过检疫监测，及早发现临床症状不明显的慢性、隐性病畜，针对性采取防制措施，防止疫病的发生和传播。尤其是对种用和乳用动物应加强检疫，通常一年一次。对牛羊重点检疫结核病、布氏杆菌病、牛病毒性腹泻/粘膜病、小反刍兽疫、羊传染性胸膜肺炎、羊痘等，对兔重点检疫兔瘟、兔巴氏杆菌病等。对检疫结果为阳性或可疑的，应按有关规定及时进行隔离治疗或淘汰处理。
五、实施预防接种，做好重点病的防制
当前危害牛羊的主要疫病有牛出败、气肿疽、牛炭疽、牛流性热、牛病毒性腹泻/粘膜病、血吸虫病、牛焦虫病、羊梭菌性疾病、羊口疮、羊痘、羊传染性胸膜肺炎、羊链球菌病等；危害兔的主要疫病有兔瘟、兔巴氏杆菌病、兔魏氏梭菌病、兔球虫病等。对于这些疫病的防治，要坚持预防为主，按计划做好免疫注射和预防驱虫，提高动物的特异性抵抗力。牛羊常用的疫苗有：牛巴氏杆菌病灭活苗、气肿疽灭活苗、无荚膜(无毒)炭疽芽胞苗、羊三联四防苗、羊口疮弱毒细胞冻干苗、羊传染性胸膜肺炎氢氧化铝菌苗、小反刍兽疫活疫苗等；兔常用的疫苗有：兔瘟-巴氏杆菌二联灭活苗、兔瘟-巴氏杆菌-魏氏梭菌三联灭活苗等。